Junto a la sala de ofrendas se encuentra el santuario de la barca sagrada. Los botes que se utilizaban para traer las imágenes de los dioses desde Karnak se mantenían aquí mientras los dioses visitaban Luxor. En Luxor, esta sala corre a lo largo del eje del templo y fue transformada en una capilla por Alejandro Magno, quien aparece ante Amón en varias de las decoraciones en los muros internos y externos. El santuario también tiene sus salas. La "Sala del Nacimiento" es una de las más populares por sus relieves, que muestran la concepción divina y nacimiento de Amenhotep. Opet significa "cámara secreta" y se refiere a las cámaras privadas del templo donde nació el ka del rey. Esta cámara fue construída en lo que se creía eran los restos del monte primordial que se levantó sobre las aguas durante la creación del mundo. El festival de Opet era la celebración del cumpleaños del Ka del Rey.